Лаборатория разведения пушных зверей была организована в институте в 1965 году путем выделения из лаборатории звероводства, кролиководства и ветеринарии. Ее первым заведующим был кандидат биологических наук Г.В. Соколов, в последующем лабораторию возглавляли кандидат биологических наук Ю.С. Заболотских, доктор сельскохозяйственных наук М.М. Мухамедянов, кандидат биологических наук И.А. Плотников.

Лаборатория разведения пушных зверей внесла значительный вклад в развитие звероводства России. Ее сотрудники участвовали в доместикации животных, в выведении новых пород и разработке методов кормления, содержания и разведения пушных зверей. Основные направления исследований:
эмбриогенез и размножение животных на гистологическом уровне и разработка метода обратного отсчета эмбрионального возраста;
биологические потребности зверей в условиях окружающей среды и разработка зоогигиенических норм содержания пушных зверей, метода полувольного разведения нутрии;
кормление животных с применением нетрадиционных кормов и метода пищевых разгрузок;
стимуляция роста, развития продуктивности пушных зверей путем применения БАВ;
селекция и доместикация животных.

Выведены новые заводские и породные группы (красная лисица огневка вятская, норка темно-коричневая дикого окраса), 5 цветовых вариаций нутрии (золотистая, лимонная, черная, снежная, пастелевая), 2 цветные формы соболей, сформирована порода русско-европейских лаек. Проведены успешные исследования по доместикации и разведению в условиях клеточного звероводства новых видов: шиншиллы, колонка, выдры, белого песца, енота-полоскуна, ондатры и сурка. Вторично введена в практику звероводства енотовидная собака.

Современные исследования направлены на решение следующих задач:
сохранение уникального генофонда видов пушных зверей, изучение возможностей введения в зоокультуру и доместикации новых видов животных;
разработка и совершенствование технологий производства продукции звероводства, в т.ч. с учетом требований Совета Европы;
изучение и внедрение новых нетрадиционных кормов для пушных зверей и новых экологичных БАВ;
изучение морфофункциональных реакций, происходящих в организме животных при введении в зоокультуру, доместикации, при разработке и совершенствовании технологий звероводства;
совершенствование экстерьерных и рабочих качеств охотничьих лаек, биология, размножение и гибридизация лаек.